جرثومة المعدة أو بكتيريا المعدة أو البكتيريا الملوية البوابية (بالإنجليزية: Helicobacter Pylori) جميعها مصطلحات تُطلق على أحد أنواع البكتيريا التي عادةً ما تنتشر في الأطعمة والمياه والأواني الملوثة، وتدخل إلى الجسم لتعيش في الجهاز الهضمي، وتُهاجم المعدة وتلحق الضرر بنسيجها المبطن لها، هذا بالإضافة إلى احتمالية إلحاقها الضرر بالجزء الأول عبر الأمعاء الدقيقة، وحقيقةً تُعدّ جرثومة المعدة عبر المشاجميع الصحية الرائجة للغاية، وهي لا تُسبب أعراضًا في كثير عبر الحالات، وبالرغم عبر عدم تسببها بحدوث قرحة المعدة (بالإنجليزية: Stomach Ulcer) في العادة، إلا أنّ السبب الأكثر شيوعًا لقرحة المعدة هو جرثومة المعدة، وبالعودة للحديث عن مدى انتشار هذه المشجميعة وشيوعها بيّنت المراكز الأمريكية لمكافحة الأمراض والوقاية منها (بالإنجليزية: Centers for Disease Control and Prevention أنّ ثلثي العالم مصابًا بهذه الجرثومة، وأكثر المصابين هم في الدول النامية، وحقيقةً يمكن حتى يُصاب الأطفال بجرثومة المعدة وليس البالغون فقط، فبالاستناد إلى نتائج الدراسة التي نُشرت في الجمعية السعودية للجهاز الهضمي (بالإنجليزية: Saudi Journal of Gastroenterology) في عام 2009 م؛ تبيّن أنّ 30-50% عبر حالات جرثومة المعدة تظهر في فترة الطفولة، ثمّ لتصل ما يُقارب 90% لدى البالغين، وذلك في الدول النامية.

ولفهم حقيقة جرثومة المعدة، لا بّد عبر بيان أنّ المعدة تُفرز في الوضع الطبيعيّ حمضًا وإنزيمًا يُعهد بالبيبسين (بالإنجليزية: Pepsin) للمساعدة على أداء وظائفها، وإنّ المعدة مُبطّنة بطبقة تحميها عبر هذا الحمض، وذلك في الوضع الطبيعيّ، ولكن طالما الإصابة بجرثومة المعدة؛ فإنّ هذه البكتيريا تُهاجم جزءًا عبر الطبقة المبطنة للمعدة، وذلك عن طريق تسبب هذه البكتيريا بإفراز إنزيم يُعهد فهميًا باسم اليورياز (بالإنجليزية: Urease)، وعليه فإنّ البكتيريا والحمض يُلحقان الضرر بصحة المعدة، وقد يتطور الأمر في بعض الحالات إلى حدّ المعاناة عبر عدد عبر المشاجميع الصحية، بما في ذلك التهاب المعدة وظهور قرحة فيها.